میرزا ابوالقاسم، پس از درگذشت عمو و پدرزنش، آقا محمدمهدی امام جمعه (نخستین امام جمعه تهران) به دستور فتحعلی شاه به امام جمعگی تهران و تولیت مسجد شاه گمارده شد.
پدرش میرزا محمد صدرالعلماء اصفهانی و از خاندان خاتون آبادی بود. جدش، میرمحمدصالح خاتون آبادی، در عهد صفویه منصب امام جمعگی اصفهان را داشت و داماد محمدباقر مجلسی بود.
او از روحانیون بانفوذ عصر خود بود و پس از آنکه امیرکبیر قدرت روحانیون را محدود ساخت، به صف مخالفان امیر پیوست.